안녕하세요~
질문 내용처럼 영재학교는 기본적으로 신입생 선발과 우선선발에 있어 전국단위 선발을 원칙으로 합니다.

서울과고와 인천과예영 두 학교는 특히 2단계 전형에 따른 우선선발 시 해당 지역의 자치구(25개,10개)에서 1명씩, 그 외 광역시·도에서 1명씩을 선발하고 있습니다.
물론 대상자가 없다고 판단될 시 선발하지 않을 수 있습니다.

* 대상자가 없다고 판단되는 경우는 2단계 전형 결과 선발 인원에 해당 지역 출신 학생이 없는 경우가 대표적입니다.